由于阿笠博士家的浴室出了故障江戶川柯南（高山南 配音）隨同小蘭（山崎和佳奈 配音）、灰原哀（林原惠美 飾）一同去大眾浴池洗澡期間柯南不小心滑倒撞到頭部隨后被兩名神秘的陌生人帶走一番混亂后天才詐欺師娜娜（深見梨加 配音）和神秘殺手近藤（香川照之 配音）將失去記憶的柯南帶到某處隱蔽的別墅并偽裝成他的父母而追蹤近藤他們的阿笠博士和灰原則遭遇嚴(yán)重車禍娜娜所屬的某個(gè)犯罪團(tuán)伙似乎打算利用制造一起炸彈恐怖襲擊與此同時(shí)供職于某雜志的編輯水島早苗（廣末涼子 配音）懷疑丈夫近藤有外遇而找到毛利小五郎調(diào)查丈夫的行蹤時(shí)間流逝險(xiǎn)惡的陰謀浮出水面……