某年的圣誕夜大批民眾聚集到某棟大廈門外抗議國(guó)家與庫(kù)贊共和國(guó)的純凈水合作計(jì)劃與此同時(shí)交通網(wǎng)絡(luò)以及相關(guān)電子系統(tǒng)遭到入侵而全面失靈隨后更有維持治安的警察掏槍射擊抗議民眾值此危急時(shí)刻公安九課少校的草薙素子（坂本真綾 配音）率領(lǐng)隊(duì)員巴特（松田健一郎 配音）、陀古薩（新垣樽助 配音）等人迅速展開(kāi)行動(dòng)與恐怖分子和黑客展開(kāi)連番惡斗這支個(gè)性滿滿且身懷絕技的機(jī)動(dòng)部隊(duì)還要追溯到2027年6月的某天時(shí)任陸軍機(jī)密部隊(duì)501機(jī)關(guān)中佐的真室在街頭被人殺害公安9課課長(zhǎng)荒卷大輔（塾一久 配音）在墓地與生化人草薙素子首次邂逅后者接受荒卷的委托追查真相在這一過(guò)程中和巴特等人邂逅這正是一段傳奇部隊(duì)“攻殼機(jī)動(dòng)隊(duì)”成立前夕的故事……　　本片根據(jù)士郎正宗的原作改編