被稱為木星蜥蜴的神秘敵人第一次襲擊地球是在2195年面對擁有壓倒性力量的敵人地球軍束手無策火星連同殖民地一起落入敵人手中這就是“第一次火星會戰(zhàn)”　　一年之后為了奪回火星民間組織尼魯加路重工以最新的科技造出新型戰(zhàn)艦NADESICO號召集來的船員包括以年輕的女艦長御統(tǒng)由利加為首她青梅竹馬的朋友身兼廚師和機(jī)師的天河名人其他船員雖然各有所長但人格和來歷都有一點問題　　在戰(zhàn)斗變得白熱化之際一個重大的真相被揭發(fā)了敵人原來是100年前被放逐到木星的地球人子孫他們想得到能夠令其運用來往行星間的瞬間移動技術(shù)玻色子跳躍的火星遺跡　　跟木連的和談以失敗告終為了爭奪火星的遺跡NADESICO、木連和尼魯加路的三方混戰(zhàn)開始了到此為止是地球跟木連戰(zhàn)斗的歷史后來地球和木連結(jié)盟宇宙總算恢復(fù)和平以上是TV版的劇情